不同光质的光穿透能力不同，在可见光的连续光谱中，其波长由大到小依次为：红一橙一黄一绿一蓝一靛一紫。其频率则是由小到大，穿透能力亦由小到大I4 J。通常波长较长的红、橙、黄光在几米深处就很容易被水体吸收掉；波长较短的绿、蓝光等能透入水体深处，这些光被水体的悬浮物质漫反射回到人眼中，构成肉眼可见的水色。

2、水色与藻类的关系

藻类是水体中的一类主要悬浮生物，不同藻类除了叶绿素外还含有各自的特征色素，色素对光的选择性吸收和漫反射不同而使藻体看起来具有不同的颜色：

蓝藻除了叶绿素外，还含有藻蓝素和藻红素，对蓝绿光的吸收少，故为蓝绿色。

绿藻含叶绿素较多，亦含叶黄素和胡萝卜素，对绿光只少量吸收，大部分以漫反射形式反射出去，看起来呈绿色。

大多数红藻虽含叶绿素、藻蓝素等，但以藻红素的含量占优势，对红光只能少量吸收，藻体通常呈红色，如紫菜、石花菜。

褐藻除含叶绿素外，还含有类胡萝卜素，主要吸收蓝紫光，因而呈现褐色。

不仅如此，不同藻类由于对自然光的选择性吸收因而在水体空间分布上具有明显的差异，对红光吸收较少，对绿、蓝、黄光吸收较多的部分红藻，生活于红光难以到达，而绿、蓝、黄光能到达的较深海水中(有的种可生活在深达100 m处)；绿藻对绿光吸收较少、对红光和蓝紫光吸收较多，而生活于包括红光在内各种光均能到达的浅水中。这种不同藻类的分层分布，有利于充分利用阳光和空问，是对环境的一种适应机制；同时不同藻类种类和数量的空间分层分布使水体具有各种各样的水色。

一般情况下藻类类群是水色的表征，不同水色下的藻类群落结构不同；而藻类生活在一定的营养中，水体营养状况是水色的重要影响因子。

硅藻在氮磷比为10：1时快速繁殖，易成为优势种，形成茶褐色水色。

绿藻在氮磷比为3——7：1时繁殖最快，易成为优势种，形成绿色水。

而其它单胞藻和大型藻类在氮磷比1：1时会快速生长形成一些不良水色。

水体的营养水平影响藻类的生长繁殖，进而影响水体浮游生物的数量和种类，导致水环境中优势种群的差异，从而影响水色。此外，所有影响藻类生长繁殖的因子对水色都具有一定程度的影响作用，如温度、光照、pH、盐度、水体底质和溶解氧等。